两层则是血清实验室,还有两层是所有人员的住所和生活区，以及最深处的一层,是两个培育室——种植着土豆和玉米。
爱丽丝们将基地内丧尸尸体和守卫尸体们纷纷清理干净,将血迹清理，并在白后的帮助下消毒。血清实验室这两层,按照麦考夫的规划，是不会动的,这里有大量的现成资料,要真正长久生存下去,研究是必须进行下去的。克隆和实景模拟这一层,被爱丽丝清理出来当做备用的住所和生活区,以防基地收纳的幸存者太多。
食物的培育室由白后精准控制温度光照和湿度,爱丽丝只需要撒种和收割。这里的玉米和土豆都是保护伞开发的新转基因品种，加上精确控制生长条件，基本上可以的达到二十天到一个月就能彻底成熟。
眼看着基地逐渐成型，爱丽丝的最后一个克隆体也在培育球中醒来。克隆体一共有60个，原本博士准备利用实景模拟，来观察克隆体的潜力，是否会在面对危险时，爆发潜力，像本体一样，进化出异能。然而还没来得及开始操作，基地已经被占领了。
爱丽丝们的分工也很明确，爱丽丝本体坐镇大局，并且配合白皇后研发血清。克隆体编号1-20号负责安保和巡逻，因为她们醒来得最早，由爱丽丝开始训练设计和体术，相对来说武力最高。暂时内部没有什么危机，所以平时都是清理地面上围着铁栏的丧尸们，以防有投靠过来的幸存者因为无法突破丧尸群而错过。
20-40号，负责维持基地运转，包括稳定电力，水过滤，信号塔，网络等等。所需要的技术和能力都可以向白后学习。
40-50号则负责后勤，打扫和食物等。50之后都是在最近才醒，暂时还没分配任何，偶尔跟着40号他们打扫打扫，然后收割一下粮食。
爱丽丝一开始依旧无法放心白后，毕竟她已经对红后有心理阴影了。然而随着时间的推移，白后在基地重建中提供了大量帮助。爱丽丝也渐渐收起了敌对心理，麦考夫走时就向她解释过了，白后的ai第一原则是以开发出血清，为了达到这个目的，白后不会在意任何立场，保护伞公司也好，爱丽丝这边也好。更何况爱丽丝的血液本身也是开发血清的关键。有了爱丽丝的配合，研究很可能在短时间内有所突破。
基地中目前已经迎来了两拨幸存者的加入。第一波毫无疑问是克莱尔的车队，当看到基地中无数个爱丽丝的时候，克莱尔和卡洛斯他们都惊呆了。并且在很长一段时间内，都无法适应，每次都会看错。最后克隆体们纷纷留了和爱丽丝不一样的发型，有的选择了更短，有的选择了更长，装束上也各着不同。至少不会错出现卡洛斯找克隆体谈心，或者找本体要食物的事了。
车队里有不少儿童和女人，刚好解放了后勤变质的爱丽丝们。补充到了第一梯队，开始学体术。因为克莱尔他们的加入，也有了不少能打的，也就可以一起更大范围的巡逻，清理附近地面的丧尸，以及寻找汽油更多物资。
第二批幸存者就是卡洛斯和爱丽丝1-5号巡逻是找到的，人数比不上车队，只有四五个人，但其中两个男子都对机械修理很擅长，他们的交通工具也都是自己改造的。
两批幸存者加起来也差不多将近四十多个人了，人多起来以后，不同的声音也多起来了。首先车队本来是以克莱尔为首，听她指挥，如今到了基地，有的人不愿意再听她的，而有的人则想推选克莱尔到基地管理层。而新来的幸存者，觉得车队的人抱团，既然他们想推一个管理，那么自己这边也应该推一个。除去对权利分配的争议，还有任务分配，车队里有人理所当然地觉得自己受保护就好，克莱尔让做事，也不听，以这个基地又不是克莱尔说了算为理由。
爱丽丝听后，第二天就宣布所有人都需要对基地有所贡献，不管是打扫也好，出去寻找物资也好，或者留下维护基地运转，机械修理等。
然而最安全的后勤位置都已经被女人和小孩占满了，做维护的需要对机械或者电子有所了解属于技术岗，而出去寻找物资，则需要冒风险，有人开始抱怨爱丽丝这是压榨他们，逼他们出去面对丧尸，让他们去送死。
不过还好，目前质疑的声音，比较少，幸存者总数都不足爱丽丝军队，所以即使抱怨，他们依旧该出去的就出去，该做事的做事。
然而这一情况在幸存者人数多起来以后，开始恶化。有人开始说爱丽丝是独裁，而基地需要民主，开始煽动这番言论，并提议推选出议会，在不罢免爱丽丝的情况下，但是爱丽丝需要和议会商量关于基地的运行和条例。
这一情况在新的基地开发后，矛盾越发明显，爱丽丝克隆人们大多被送到了新的基地，而爱丽丝本体也时常不在这个基地。她只能在每次回来的时候，听到克隆爱丽丝向自己汇报基地的情况。
爱丽丝有些心累，其实她更适合去战斗而不是管理，她多次向克莱尔提出，希望她暂代这边的管理人，然而克莱尔却拒绝了，“这个基地是你和传说中的三人打下来的，我可以帮助你管理基地，但是我没有资格代替你成为管理人。”
同样的话卡洛斯也说过，信任的人不愿意，其他愿意的人爱丽丝又信不过。
然而爱丽丝的困境，却在麦考夫回到基地的当天，就被麦考夫轻而易举地解决了。
麦考夫听爱丽丝描述了现状后，立